Сугубо на уровне мнений. Пока не смотрел в бэк, потому цена невелика.

1. Да, может. Собственно, способности навигаторов во многом растут из того же корня. Обучаться, скорее всего, будет силами собственного Дома. Судя по флафф-библии у Navis Nobilite хватает прав на то, чтобы быть исключением из многих законов, а за то, чтобы не выдавать полноценного навигатора на сторону члены Домов будут драться руками и зубами. Причём даже враждующие стороны тут, видимо, примирятся - сегодня в секретах одного Дома дадим покопаться, а завтра Инквизиция будет нос совать повсюду? Шиш!
2. Очень большой вопрос. Подозреваю, что доверия к нему не будет ни у одной из сторон - потому хотя
формально может, реально, видимо, будет как минимум найден какой-нибудь формальный повод лишить его всех связей той стороной, которая сочтёт его "предателем".